Pelaksanaan merupakan tahap dalam siklus SPMI yang memastikan standar mutu yang telah ditetapkan dapat diimplementasikan dalam kegiatan akademik dan non-akademik di seluruh unit kerja di Universitas Diponegoro.
Dalam pelaksanaannya, seluruh aktivitas dan capaian mutu didokumentasikan secara sistematis serta didukung oleh sistem informasi terintegrasi berbasis Single Sign-On (SSO). Berbagai aplikasi digunakan sesuai kebutuhan, antara lain SIAP untuk pengelolaan akademik, SIP3MU untuk pengelolaan kegiatan penelitian dan pengabdian kepada masyarakat, serta E-duk untuk pengelolaan data kepegawaaian.
Pemanfaatan sistem ini bertujuan untuk memastikan proses pelaksanaan berjalan terarah, terdokumentasi dengan baik, serta memudahkan pemantauan dan evaluasi secara berkelanjutan.